RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 WWC1Q8IX03 1113 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-211ENST00000589631 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC93Q567U6 631 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 NLRP10Q86W26 655 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 NLRP3Q96P20 1036 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 IL16Q14005 1332 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.1■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 GLTPD2A6NH11 291 aa26.1■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 TOMM70O94826 608 aa26.1■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.1■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.1■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.08■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.08■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.08■■□□□ 1.77
GIPC1-211ENST00000589631 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
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GIPC1-211ENST00000589631 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.07■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.07■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 TSPYL6Q8N831 410 aa26.07■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 RRAGCQ9HB90 399 aa26.07■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.07■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 WDR63Q8IWG1 891 aa26.06■■□□□ 1.76
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GIPC1-211ENST00000589631 GOLGA2Q08379 1002 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 OLFM4Q6UX06 510 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 LAMB2P55268 1798 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 SYNE4Q8N205 404 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 PSMD1Q99460 953 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 SNED1Q8TER0 1413 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-211ENST00000589631 HSPA6P17066 643 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
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GIPC1-211ENST00000589631 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
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GIPC1-211ENST00000589631 ABCC4O15439 1325 aa25.98■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 BBOX1O75936 387 aa25.98■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 FAM89AQ96GI7 184 aa25.98■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.97■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.97■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 POTECB2RU33 542 aa25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 FSTL1Q12841 308 aa25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
GIPC1-211ENST00000589631 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 KSR2Q6VAB6 950 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF428Q96B54 188 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 MYD88Q99836 296 aa25.95■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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GIPC1-211ENST00000589631 TAF1P21675 1872 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 SLC4A2P04920 1241 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 GRAPQ13588 217 aa25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 FZD9O00144 591 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 VAMP4O75379 141 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 TMC4Q7Z404 712 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 VPS33BQ9H267 617 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.92■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.91■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.91■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.91■■□□□ 1.74
GIPC1-211ENST00000589631 JDP2Q8WYK2 163 aa25.91■■□□□ 1.74
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