RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-223	ENST00000589266		A0A087WZG4	1122 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	MS4A1	P11836	297 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	SERPINB2	P05120	415 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	COPS6	Q7L5N1	327 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		31.83	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		31.83	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	COL15A1	P39059	1388 aa		31.82	■■■□□ 2.69
CIRBP-223	ENST00000589266	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		31.82	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266		H0YIN7	160 aa		31.82	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	RGL2	O15211	777 aa		31.81	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	PDE3A	Q14432	1141 aa		31.81	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		31.81	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.81	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	TRIM27	P14373	513 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	NFKBIE	O00221	500 aa		31.79	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		31.79	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		31.78	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	POTEC	B2RU33	542 aa		31.77	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		31.77	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		31.76	■■■□□ 2.68
CIRBP-223	ENST00000589266	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.76	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.76	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	ABCC4	O15439	1325 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	PLIN1	O60240	522 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		31.73	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.73	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	ERFE	Q4G0M1	354 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	31.72	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	CAMTA2	O94983	1202 aa		31.7	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.7	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	CREBZF	Q9NS37	354 aa		31.7	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.7	■■■□□ 2.67
CIRBP-223	ENST00000589266	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266		F6X3S4	739 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	C21orf2	O43822	256 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	PDE6B	P35913	854 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	CHADL	Q6NUI6	762 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	TNN	Q9UQP3	1299 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	NUP98	P52948	1817 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	ALDH1L1	O75891	902 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	RLBP1	P12271	317 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	BEND3	Q5T5X7	828 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	PANK1	Q8TE04	598 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CIRBP-223	ENST00000589266	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	HLF	Q16534	295 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	MYD88	Q99836	296 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		31.61	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	NEFL	P07196	543 aa		31.6	■■■□□ 2.65
CIRBP-223	ENST00000589266	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		31.6	■■■□□ 2.65

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