RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NGEFQ8N5V2 710 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NBPF15Q8N660 670 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NYXQ9GZU5 481 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 MCM10Q7L590 875 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 RGL2O15211 777 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 AOC2O75106 756 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 SCNN1DP51172 638 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NIM1KQ8IY84 436 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CST9Q5W186 159 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TLL2Q9Y6L7 1015 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 MAP2K2P36507 400 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 RGS19P49795 217 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CFAP53Q96M91 514 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CRY2Q49AN0 593 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCC12Q96J65 1359 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 LTBP1Q14766 1721 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CELF2O95319 508 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 COL4A5P29400 1685 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 PPIP5K2O43314 1243 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 THSD7BQ9C0I4 1608 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 TRPM7Q96QT4 1865 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CA12O43570 354 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 DCTN1Q14203 1278 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF408Q9H9D4 720 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 NUDCQ9Y266 331 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 GPTP24298 496 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 SNED1Q8TER0 1413 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 DGKZQ13574 1117 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 AOC3Q16853 763 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 SAPCD2Q86UD0 394 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 GPRC5DQ9NZD1 345 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 MIS18AQ9NYP9 233 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC51AQ86UW1 340 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.97■■■□□ 2.23
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CAPNS1-205ENST00000588780 MYL6BP14649 208 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 SUSD4Q5VX71 490 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-205ENST00000588780 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 CXCL9Q07325 125 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 HHIPL1Q96JK4 782 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 NLRP3Q96P20 1036 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 NUP98P52948 1817 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS33BQ9H267 617 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
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CAPNS1-205ENST00000588780 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 RAD17O75943 681 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 NOGQ13253 232 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-205ENST00000588780 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.88■■■□□ 2.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 NEFMP07197 916 aa28.88■■■□□ 2.21
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-205ENST00000588780 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-205ENST00000588780 H7C1D1 291 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-205ENST00000588780 PARP10Q53GL7 1025 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-205ENST00000588780 USP48Q86UV5 1035 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-205ENST00000588780 MPNDQ8N594 471 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-205ENST00000588780 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-205ENST00000588780 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-205ENST00000588780 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
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