RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 HECW1Q76N89 1606 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 NCOA2Q15596 1464 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 ELOA3Q8NG57 546 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 NAIPQ13075 1403 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 MIA2Q96PC5 1412 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 SOX11P35716 441 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 SYT9Q86SS6 491 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 ARHGEF11O15085 1522 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-212ENST00000580838 BACH1O14867 736 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF358Q9NW07 568 aa7.96□□□□□ -1.14
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PTPRM-212ENST00000580838 EPHA4P54764 986 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 GTF2IP78347 998 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 TEAD4Q15561 434 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 EML3Q32P44 896 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 SIN3BO75182 1162 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ALAS2P22557 587 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 NOS2P35228 1153 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 TBCELQ5QJ74 424 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 SLC30A3Q99726 388 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 NOD1Q9Y239 953 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 SKIP12755 728 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ROCK1Q13464 1354 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRM-212ENST00000580838 FAM229AH3BQW9 127 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 M0R082 166 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 MCM6Q14566 821 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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PTPRM-212ENST00000580838 PSME1Q06323 249 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 NCOA4Q13772 614 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 TNS4Q8IZW8 715 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ALG2Q9H553 416 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 IQGAP2Q13576 1575 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 PTPRKQ15262 1439 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 APBA3O96018 575 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 ALBP02768 609 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 TNFRSF25Q93038 417 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-212ENST00000580838 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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PTPRM-212ENST00000580838 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 SERTM1A2A2V5 107 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 SPEM2Q0P670 501 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 COG6Q9Y2V7 657 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 WDR62O43379 1518 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 DYRK3O43781 588 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 NID1P14543 1247 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 ADAMTS12P58397 1594 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 PBRM1Q86U86 1689 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L5A8MUK1 530 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 ADH7P40394 386 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-212ENST00000580838 NCOA1Q15788 1441 aa7.86□□□□□ -1.15
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