RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 CXCL9Q07325 125 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 KRT26Q7Z3Y9 468 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 NIM1KQ8IY84 436 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 DPF3Q92784 378 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 LRCH3Q96II8 777 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM17Q9Y577 477 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 DLEC1Q9Y238 1755 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 COL15A1P39059 1388 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 KIF24Q5T7B8 1368 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CACNA1SQ13698 1873 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 MON2Q7Z3U7 1717 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 NRXN2Q9P2S2 1712 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SLC39A6Q13433 755 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 GRIPAP1Q4V328 841 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 AMOTQ4VCS5 1084 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 C1orf141Q5JVX7 400 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TPTE2Q6XPS3 522 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 OTOP1Q7RTM1 612 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 DEFB123Q8N688 67 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TRPM4Q8TD43 1214 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 L3MBTL2Q969R5 705 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ARMC5Q96C12 935 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 BCL11AQ9H165 835 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 PRO3102Q9H379 93 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ZNRF3Q9ULT6 936 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 VCANP13611 3396 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 WASHC2AQ641Q2 1341 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF831Q5JPB2 1677 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CENPFP49454 3210 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 A0A1W2PPC1 479 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SHTN1A0MZ66 631 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 FAM177BA6PVY3 158 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ADM5C9JUS6 153 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 PPIP5K2O43314 1243 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 RAD17O75943 681 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CAMTA2O94983 1202 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TNIP1Q15025 636 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SAMD7Q7Z3H4 446 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 NBPF11Q86T75 865 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 VSIG10Q8N0Z9 540 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 FAM122AQ96E09 287 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 VPS33BQ9H267 617 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 LGR6Q9HBX8 967 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 LAMA3Q16787 3333 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 A1BGP04217 495 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 PLA2G5P39877 138 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 FKBP1BP68106 108 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 AOC3Q16853 763 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 GPR153Q6NV75 609 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 Q7L0L9 218 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SULF1Q8IWU6 871 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 MICALL2Q8IY33 904 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 DPF2Q92785 391 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF333Q96JL9 665 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CFHR5Q9BXR6 569 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 EFCC1Q9HA90 598 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SLC52A2Q9HAB3 445 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 STAP2Q9UGK3 403 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ERBB4Q15303 1308 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 TTC28Q96AY4 2481 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.8 ms