RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569224.1

DDX19B-215, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 2

Gene DDX19B, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-215	ENST00000569224	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	KCNA3	P22001	575 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	MYD88	Q99836	296 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DDX19B-215	ENST00000569224	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	DPEP1	P16444	411 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	PTPRC	P08575	1304 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224		A0A0G2JLW4	131 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	NPHP1	O15259	732 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	CHRNA5	P30532	468 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	PDE6B	P35913	854 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224		F6X3S4	739 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	MYH3	P11055	1940 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	SRGN	P10124	158 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	UTRN	P46939	3433 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224		H0YIN7	160 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	BCAR3	O75815	825 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	NPR1	P16066	1061 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	GCKR	Q14397	625 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224	COL4A1	P02462	1669 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX19B-215	ENST00000569224		H7C1W4	665 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	CASP7	P55210	303 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	ABCC4	O15439	1325 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	GPR162	Q16538	588 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	TAF1	P21675	1872 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	TRIM27	P14373	513 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	CHD4	Q14839	1912 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	UTY	O14607	1347 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	GRM8	O00222	908 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX19B-215	ENST00000569224	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.8	□□□□□ -0.52

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