RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.56■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 LMNB1P20700 586 aa27.55■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 ALDH1B1P30837 517 aa27.55■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 PRELPP51888 382 aa27.54■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 SOGA3Q5TF21 947 aa27.54■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.54■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.54■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA2Q08379 1002 aa27.52■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 NLRP3Q96P20 1036 aa27.52■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
RNPS1-218ENST00000566180 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.51■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.51■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.5■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.49■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.49■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 CCER2I3L3R5 266 aa27.49■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC93Q567U6 631 aa27.49■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 STK31Q9BXU1 1019 aa27.49■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.49■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 SYNE4Q8N205 404 aa27.48■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.48■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 SLX4Q8IY92 1834 aa27.47■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 C1QTNF8P60827 252 aa27.47■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF521Q96K83 1311 aa27.46■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.46■■□□□ 1.99
RNPS1-218ENST00000566180 VAMP4O75379 141 aa27.45■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 OLFM4Q6UX06 510 aa27.45■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.45■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 SLC4A2P04920 1241 aa27.44■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF428Q96B54 188 aa27.44■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 KIF3CO14782 793 aa27.43■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 FAM89AQ96GI7 184 aa27.43■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 MYD88Q99836 296 aa27.43■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.42■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.42■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 KSR2Q6VAB6 950 aa27.42■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.41■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.41■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 G2E3Q7L622 706 aa27.41■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.41■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.41■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.4■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.4■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.4■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
RNPS1-218ENST00000566180 GLTPD2A6NH11 291 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 SNED1Q8TER0 1413 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 SBF1O95248 1867 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 ABCC4O15439 1325 aa27.38■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 PSMD1Q99460 953 aa27.37■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.36■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 BBOX1O75936 387 aa27.36■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 FLIIQ13045 1269 aa27.36■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.35■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 IGKV5-2P06315 115 aa27.34■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 GRAPQ13588 217 aa27.34■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.34■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 RRAGCQ9HB90 399 aa27.34■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.33■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 SLC51AQ86UW1 340 aa27.33■■□□□ 1.97
RNPS1-218ENST00000566180 E9PSI1 815 aa27.32■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 TOMM70O94826 608 aa27.31■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 SP8Q8IXZ3 490 aa27.31■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 CACNA1SQ13698 1873 aa27.31■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 NEURL1BA8MQ27 555 aa27.29■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 SLFN5Q08AF3 891 aa27.29■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 TMC4Q7Z404 712 aa27.29■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.29■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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