RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMX3Q96JJ7 454 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.58■■□□□ 1.53
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CCNDBP1-205ENST00000564630 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP7D2Q96T17 732 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 BTBD11A6QL63 1104 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.57■■□□□ 1.52
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 SRGAP3O43295 1099 aa24.55■■□□□ 1.52
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CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 APBA3O96018 575 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC125Q86Z20 511 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADCY9O60503 1353 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 CUL4AQ13619 759 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 BTAF1O14981 1849 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITGB4P16144 1822 aa24.52■■□□□ 1.52
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ANXA1P04083 346 aa24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL25Q9H293 177 aa24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBSNQ9H1K0 784 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 BAG6P46379 1132 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPA4P34932 840 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTX1Q13505 466 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNTROBQ8N137 903 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 SGSM2O43147 1006 aa24.46■■□□□ 1.51
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CCNDBP1-205ENST00000564630 BRD1O95696 1058 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPT2Q8TD30 523 aa24.46■■□□□ 1.51
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ALDH1L1O75891 902 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MBD3O95983 291 aa24.46■■□□□ 1.51
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CCNDBP1-205ENST00000564630 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAD50Q92878 1312 aa24.46■■□□□ 1.51
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 KSR2Q6VAB6 950 aa24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 PROSER3Q2NL68 480 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIGBQ92521 554 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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CCNDBP1-205ENST00000564630 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 DYNC1I1O14576 645 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 CABP4P57796 275 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 HYPKQ9NX55 129 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 RREB1Q92766 1687 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLSCR1O15162 318 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLHL34Q8N239 644 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-205ENST00000564630 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-205ENST00000564630 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
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