RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.15■■□□□ 1.46
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CTU2-204ENST00000564105 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 GCKRQ14397 625 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 LAMB2P55268 1798 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 GYS1P13807 737 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 NLRP10Q86W26 655 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 MEIS3Q99687 375 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 USP44Q9H0E7 712 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 GRM8O00222 908 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 GNAI3P08754 354 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 PARP10Q53GL7 1025 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 SETDB2Q96T68 719 aa24.08■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 UTYO14607 1347 aa24.08■■□□□ 1.45
CTU2-204ENST00000564105 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 AAMPQ13685 434 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 SYT17Q9BSW7 474 aa24.08■■□□□ 1.44
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CTU2-204ENST00000564105 SUSD4Q5VX71 490 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 FAM177BA6PVY3 158 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 H7C1W4 665 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 NFIXQ14938 502 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
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CTU2-204ENST00000564105 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.05■■□□□ 1.44
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CTU2-204ENST00000564105 FAM89AQ96GI7 184 aa24.04■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.04■■□□□ 1.44
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CTU2-204ENST00000564105 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.03■■□□□ 1.44
CTU2-204ENST00000564105 MSL1Q68DK7 614 aa24.03■■□□□ 1.44
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CTU2-204ENST00000564105 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.02■■□□□ 1.44
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CTU2-204ENST00000564105 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 SPEF2Q9C093 1822 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
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CTU2-204ENST00000564105 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 DDR1Q08345 913 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 KAZALD1Q96I82 304 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.99■■□□□ 1.43
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CTU2-204ENST00000564105 NPHP1O15259 732 aa23.97■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 MMP10P09238 476 aa23.97■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 ERFEQ4G0M1 354 aa23.97■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.96■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 CNBD1Q8NA66 436 aa23.96■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.96■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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CTU2-204ENST00000564105 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.96■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 POLD1P28340 1107 aa23.95■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 CEP85Q6P2H3 762 aa23.95■■□□□ 1.43
CTU2-204ENST00000564105 CACNA1SQ13698 1873 aa23.95■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 ABCC12Q96J65 1359 aa23.94■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 PDE8AO60658 829 aa23.94■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 FOXO4P98177 505 aa23.94■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.94■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.94■■□□□ 1.42
CTU2-204ENST00000564105 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.93■■□□□ 1.42
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