RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 SLC4A2P04920 1241 aa26.88■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 STYK1Q6J9G0 422 aa26.88■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 MASTLQ96GX5 879 aa26.88■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.87■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.87■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.87■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 SLFN5Q08AF3 891 aa26.86■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 G2E3Q7L622 706 aa26.86■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF428Q96B54 188 aa26.86■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.86■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 NPR1P16066 1061 aa26.85■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 CNKSR1Q969H4 720 aa26.85■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.85■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 CRY2Q49AN0 593 aa26.84■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 MYD88Q99836 296 aa26.83■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.83■■□□□ 1.89
TMOD3-203ENST00000558455 ADCY9O60503 1353 aa26.83■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 FLIIQ13045 1269 aa26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 KSR2Q6VAB6 950 aa26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 SYNE4Q8N205 404 aa26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.82■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.81■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 C21orf2O43822 256 aa26.79■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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TMOD3-203ENST00000558455 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 FAM89AQ96GI7 184 aa26.78■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 NLRP3Q96P20 1036 aa26.78■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 CACNA1SQ13698 1873 aa26.76■■□□□ 1.88
TMOD3-203ENST00000558455 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 RASSF7Q02833 373 aa26.76■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.76■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 ALDH1B1P30837 517 aa26.75■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 CACNA1FO60840 1977 aa26.75■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 NFKBIEO00221 500 aa26.74■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 IGKV5-2P06315 115 aa26.74■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.74■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.74■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.73■■□□□ 1.87
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TMOD3-203ENST00000558455 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.72■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.72■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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TMOD3-203ENST00000558455 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 LAMB2P55268 1798 aa26.71■■□□□ 1.87
TMOD3-203ENST00000558455 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.7■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC93Q567U6 631 aa26.7■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 OLFM4Q6UX06 510 aa26.7■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 RNF181Q9P0P0 153 aa26.7■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 PRELPP51888 382 aa26.69■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 ABCC4O15439 1325 aa26.68■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 F6X3S4 739 aa26.68■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 LMNB1P20700 586 aa26.68■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.68■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.68■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.67■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.66■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 LINS1Q8NG48 757 aa26.66■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.66■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 SBF1O95248 1867 aa26.66■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 SLC51AQ86UW1 340 aa26.65■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.65■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 GCKRQ14397 625 aa26.64■■□□□ 1.86
TMOD3-203ENST00000558455 SNED1Q8TER0 1413 aa26.64■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 GRAPQ13588 217 aa26.63■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.63■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 BEND3Q5T5X7 828 aa26.63■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.63■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 PDE8AO60658 829 aa26.62■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.62■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.62■■□□□ 1.85
TMOD3-203ENST00000558455 H7C1W4 665 aa26.61■■□□□ 1.85
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