RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	PIK3C2B	O00750	1634 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	ARHGEF15	O94989	841 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	YY1	P25490	414 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	MST1R	Q04912	1400 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	PTCH1	Q13635	1447 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SCFD1-223	ENST00000557076	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	PTPRU	Q92729	1446 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ERVK-9	P63128	1117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	MEN1	O00255	615 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	RHOQ	P17081	205 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	BAG6	P46379	1132 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ORAI2	Q96SN7	254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ADGRB3	O60242	1522 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ABCC5	O15440	1437 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	CEP152	O94986	1710 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076		A0A1W2PRU2	124 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076		H7C1W4	665 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	NR1H3	Q13133	447 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	GAS6	Q14393	721 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	NEUROD2	Q15784	382 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	IRS1	P35568	1242 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	CLN3	Q13286	438 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	BANK1	Q8NDB2	785 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	MET	P08581	1390 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	APBB1	O00213	710 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	FOXK2	Q01167	660 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	VPS72	Q15906	364 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SCFD1-223	ENST00000557076	LRP5	O75197	1615 aa		7.34	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	IGHA1	P01876	353 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	IL27	Q8NEV9	243 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	FOXO3	O43524	673 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	DBN1	Q16643	649 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	MYOM2	P54296	1465 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	TRAK2	O60296	914 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	SCTR	P47872	440 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	POU4F2	Q12837	409 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	TRPM2	O94759	1503 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SCFD1-223	ENST00000557076	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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