RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	HLF	Q16534	295 aa		9.08	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	OLFM4	Q6UX06	510 aa		9.08	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		9.08	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ABHD8	Q96I13	439 aa		9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	MAP2K2	P36507	400 aa		9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	DCTN1	Q14203	1278 aa		9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	NIM1K	Q8IY84	436 aa		9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		9.06	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	CA12	O43570	354 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	PPP2R1A	P30153	589 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	EPS15	P42566	896 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	SCNN1D	P51172	638 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	PARP10	Q53GL7	1025 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	NGEF	Q8N5V2	710 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	CAPNS2	Q96L46	248 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	NLRP3	Q96P20	1036 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	SNED1	Q8TER0	1413 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ERBB4	Q15303	1308 aa		9.05	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	SUSD4	Q5VX71	490 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		9.04	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ABCC12	Q96J65	1359 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	PPIP5K2	O43314	1243 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	BBOX1	O75936	387 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	RGS19	P49795	217 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	CST9	Q5W186	159 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		9.03	□□□□□ -0.96
CS-233	ENST00000552688	NTSR2	O95665	410 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	MYL6B	P14649	208 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	GPT	P24298	496 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	TNIP1	Q15025	636 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	SP8	Q8IXZ3	490 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		9.02	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	TRAF5	O00463	557 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	SLC34A2	O95436	690 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	CXCL9	Q07325	125 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	GRM1	Q13255	1194 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	AOC3	Q16853	763 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	FAM161A	Q3B820	660 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	TMC4	Q7Z404	712 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		9.01	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	NFE2L2	Q16236	605 aa		9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	MPND	Q8N594	471 aa		9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		9	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688		H7C1D1	291 aa		8.99	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	8.99	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	8.99	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	NOG	Q13253	232 aa		8.99	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	8.99	□□□□□ -0.97
CS-233	ENST00000552688	DPF2	Q92785	391 aa		8.99	□□□□□ -0.97

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