RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 H3BM21 787 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 RAB11FIP3O75154 756 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 BMP1P13497 986 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 SLC20A2Q08357 652 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 MSS51Q4VC12 460 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 GORABQ5T7V8 394 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TXNDC2Q86VQ3 553 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 C8orf37Q96NL8 207 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CARD14Q9BXL6 1004 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRB-207ENST00000549400 ERBB4Q15303 1308 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ATP7BP35670 1465 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 KCNA1Q09470 495 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CCDC96Q2M329 555 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 GGT6Q6P531 493 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 SULF1Q8IWU6 871 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 SMC5Q8IY18 1101 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 KNSTRNQ9Y448 316 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 NSD3Q9BZ95 1437 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 SLIT1O75093 1534 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 PNPLA6Q8IY17 1366 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 EXOC5O00471 708 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TCF3P15923 654 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 DMTNQ08495 405 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 KCNMA1Q12791 1236 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 CYB5RLQ6IPT4 315 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TRIM46Q7Z4K8 759 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 GPATCH3Q96I76 525 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-207ENST00000549400 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-207ENST00000549400 LRRC7Q96NW7 1537 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 A0A1W2PP64 1363 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 EVC2Q86UK5 1308 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 CLCN1P35523 988 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 GCGRP47871 477 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 AK7Q96M32 723 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 MON2Q7Z3U7 1717 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 DIP2AQ14689 1571 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 TSPOAP1O95153 1857 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 CGNL1Q0VF96 1302 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 GNPATO15228 680 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 LONRF3Q496Y0 759 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 MORC4Q8TE76 937 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 MKL1Q969V6 931 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 PTCH1Q13635 1447 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 KIF20BQ96Q89 1820 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 ZMYM3Q14202 1370 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 TMEM2Q9UHN6 1383 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 C3P01024 1663 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 USP54Q70EL1 1684 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-207ENST00000549400 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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