RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-208	ENST00000549107	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	NUP98	P52948	1817 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	HLF	Q16534	295 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	LY75	O60449	1722 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	SEC24B	O95487	1268 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	PDE1A	P54750	535 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	FOXO4	P98177	505 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	MX1	P20591	662 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	GPT	P24298	496 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	AOX1	Q06278	1338 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-208	ENST00000549107	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	CDC45	O75419	566 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	KCNQ4	P56696	695 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	SASH1	O94885	1247 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	SIL1	Q9H173	461 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	SDS	P20132	328 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	AACS	Q86V21	672 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	MYH3	P11055	1940 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	RGL2	O15211	777 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	CSF1R	P07333	972 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	LAMB2	P55268	1798 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-208	ENST00000549107	GNPAT	O15228	680 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CTSW	P56202	376 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	PDE8A	O60658	829 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CIAO1	O76071	339 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	TRIM37	O94972	964 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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