RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547694.2

GIT2-208, Transcript of GIT ArfGAP 2, human

TSL 3

Gene GIT2, Length 667 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIT2-208	ENST00000547694	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	C21orf2	O43822	256 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	NUP98	P52948	1817 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	SBF1	O95248	1867 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	NFKBIE	O00221	500 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	NTSR2	O95665	410 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	PRELP	P51888	382 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	CRY2	Q49AN0	593 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	NLRP10	Q86W26	655 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	CCDC93	Q567U6	631 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TNS4	Q8IZW8	715 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	TSPYL6	Q8N831	410 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.02	□□□□□ -0.8
GIT2-208	ENST00000547694	POTEC	B2RU33	542 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	CCER2	I3L3R5	266 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	BBOX1	O75936	387 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	SLX4	Q8IY92	1834 aa		10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	KSR2	Q6VAB6	950 aa		10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	MYD88	Q99836	296 aa		10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	VAMP4	O75379	141 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	CAPN15	O75808	1086 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	TMC4	Q7Z404	712 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	SYNE4	Q8N205	404 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	FAM89A	Q96GI7	184 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	PSMD1	Q99460	953 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	CREBZF	Q9NS37	354 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	CACNA1S	Q13698	1873 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	GRAP	Q13588	217 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GIT2-208	ENST00000547694	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81

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