RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.7■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.7■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 NLRP10Q86W26 655 aa22.7■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 SYT17Q9BSW7 474 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 H0YIN7 160 aa22.68■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 LINS1Q8NG48 757 aa22.68■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 SUSD4Q5VX71 490 aa22.67■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.66■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.66■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.65■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 NTSR2O95665 410 aa22.65■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.65■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.65■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.64■■□□□ 1.22
BRF1-209ENST00000547052 F6X3S4 739 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 ALDH1L1O75891 902 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 MS4A1P11836 297 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 NLRP3Q96P20 1036 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 ERFEQ4G0M1 354 aa22.63■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 PIM2Q9P1W9 311 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 BCAR3O75815 825 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 GCKRQ14397 625 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 MASTLQ96GX5 879 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 DPEP1P16444 411 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 BEND3Q5T5X7 828 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 CNKSR1Q969H4 720 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 FAM89AQ96GI7 184 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 ABCC12Q96J65 1359 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 A0A0G2JLW4 131 aa22.58■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 IGKV5-2P06315 115 aa22.58■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 NPR1P16066 1061 aa22.58■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 GPR162Q16538 588 aa22.58■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.58■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
BRF1-209ENST00000547052 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.57■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 CHD4Q14839 1912 aa22.57■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 ALDH1B1P30837 517 aa22.57■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 STYK1Q6J9G0 422 aa22.57■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.57■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 PDE8AO60658 829 aa22.56■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 CHRNA5P30532 468 aa22.56■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 TTLL6Q8N841 843 aa22.56■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 GRM8O00222 908 aa22.55■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.55■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 SRGNP10124 158 aa22.54■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 BCS1LQ9Y276 419 aa22.54■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 SPEF2Q9C093 1822 aa22.53■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 GRIN3BO60391 1043 aa22.53■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 TRIM27P14373 513 aa22.53■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 SOGA3Q5TF21 947 aa22.53■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 ABCC4O15439 1325 aa22.53■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 SLX4Q8IY92 1834 aa22.52■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 H7C1W4 665 aa22.52■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 CRY2Q49AN0 593 aa22.52■■□□□ 1.2
BRF1-209ENST00000547052 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.51■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 TAF1P21675 1872 aa22.51■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 GNAI3P08754 354 aa22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
BRF1-209ENST00000547052 CTSWP56202 376 aa22.49■■□□□ 1.19
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