RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 PROSER3Q2NL68 480 aa21.93■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.93■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 CRY2Q49AN0 593 aa21.93■■□□□ 1.1
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CASP9-211ENST00000546969 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.92■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.92■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.91■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 NTSR2O95665 410 aa21.91■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 PRELPP51888 382 aa21.91■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 KRT24Q2M2I5 525 aa21.91■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.91■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 MBIPQ9NS73 344 aa21.91■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 ABCC12Q96J65 1359 aa21.9■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 TCIRG1Q13488 830 aa21.9■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.9■■□□□ 1.1
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CASP9-211ENST00000546969 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.89■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.88■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 ZNF853P0CG23 659 aa21.87■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.87■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 NLRP10Q86W26 655 aa21.87■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 SYNE4Q8N205 404 aa21.87■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 JDP2Q8WYK2 163 aa21.87■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 MRS2Q9HD23 443 aa21.87■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.86■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.86■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 GOLGA2Q08379 1002 aa21.86■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 PSMD1Q99460 953 aa21.86■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.84■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.84■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 BBOX1O75936 387 aa21.83■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 OLFM4Q6UX06 510 aa21.83■■□□□ 1.09
CASP9-211ENST00000546969 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 CCDC27Q2M243 656 aa21.82■■□□□ 1.08
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CASP9-211ENST00000546969 WDR90Q96KV7 1748 aa21.8■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.8■■□□□ 1.08
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CASP9-211ENST00000546969 STK31Q9BXU1 1019 aa21.8■■□□□ 1.08
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CASP9-211ENST00000546969 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.79■■□□□ 1.08
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CASP9-211ENST00000546969 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.78■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 CCDC184Q52MB2 194 aa21.78■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.78■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.78■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 VPS33BQ9H267 617 aa21.78■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 ABCC4O15439 1325 aa21.78■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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CASP9-211ENST00000546969 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.77■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 HACL1Q9UJ83 578 aa21.77■■□□□ 1.08
CASP9-211ENST00000546969 POTECB2RU33 542 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 FZD9O00144 591 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 GRAPQ13588 217 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 CHADLQ6NUI6 762 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 WWC1Q8IX03 1113 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 SP8Q8IXZ3 490 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 GPC2Q8N158 579 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 FAM89AQ96GI7 184 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 IL16Q14005 1332 aa21.76■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 PPIP5K2O43314 1243 aa21.75■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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CASP9-211ENST00000546969 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 LDHDQ86WU2 507 aa21.74■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.74■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.74■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.73■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 MYD88Q99836 296 aa21.73■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.73■■□□□ 1.07
CASP9-211ENST00000546969 SCN4AP35499 1836 aa21.73■■□□□ 1.07
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