RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 NBPF4Q96M43 638 aa11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1-202ENST00000546471 ARID3AQ99856 593 aa11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1-202ENST00000546471 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1-202ENST00000546471 KIF3AQ9Y496 699 aa11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1-202ENST00000546471 LTN1O94822 1766 aa11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1-202ENST00000546471 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.21□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 KSR2Q6VAB6 950 aa11.21□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.21□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC27A2O14975 620 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 AP5Z1O43299 807 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TTC6Q86TZ1 520 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM227BQ96M60 508 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 DTNBO60941 627 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SPC24Q8NBT2 197 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SNRKQ9NRH2 765 aa11.2□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TYRO3Q06418 890 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 FERMT3Q86UX7 667 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 NCAPD2Q15021 1401 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 FSD1Q9BTV5 496 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TNMDQ9H2S6 317 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.19□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 GRM8O00222 908 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 KCNA6P17658 529 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 RPS6KB1P23443 525 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CAMK4Q16566 473 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 LINS1Q8NG48 757 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA32Q96LK8 384 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 NFAT5O94916 1531 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SASH1O94885 1247 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 LIG1P18858 919 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A0D9SFI3 127 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 PROSER3Q2NL68 480 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 KCNH5Q8NCM2 988 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TSC1Q92574 1164 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SUCLG2Q96I99 432 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 DACT1Q9NYF0 836 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 MED23Q9ULK4 1368 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 UTYO14607 1347 aa11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 LUZP1Q86V48 1076 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 PTGS1P23219 599 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 KRT32Q14532 448 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 DRC7Q8IY82 874 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 CBX8Q9HC52 389 aa11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 STK3Q13188 491 aa11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 BICD2Q8TD16 824 aa11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 KAZALD1Q96I82 304 aa11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 SIL1Q9H173 461 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms