RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 STK31Q9BXU1 1019 aa28.96■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.96■■■□□ 2.23
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CCDC189-211ENST00000545825 NPR1P16066 1061 aa28.95■■■□□ 2.22
CCDC189-211ENST00000545825 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.95■■■□□ 2.22
CCDC189-211ENST00000545825 CRY2Q49AN0 593 aa28.94■■■□□ 2.22
CCDC189-211ENST00000545825 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.94■■■□□ 2.22
CCDC189-211ENST00000545825 ADCY9O60503 1353 aa28.93■■■□□ 2.22
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CCDC189-211ENST00000545825 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.93■■■□□ 2.22
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CCDC189-211ENST00000545825 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.91■■■□□ 2.22
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CCDC189-211ENST00000545825 C21orf2O43822 256 aa28.9■■■□□ 2.22
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CCDC189-211ENST00000545825 G2E3Q7L622 706 aa28.9■■■□□ 2.22
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF428Q96B54 188 aa28.9■■■□□ 2.22
CCDC189-211ENST00000545825 SYNE4Q8N205 404 aa28.89■■■□□ 2.22
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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CCDC189-211ENST00000545825 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.88■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 E9PSI1 815 aa28.87■■■□□ 2.21
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CCDC189-211ENST00000545825 RASSF7Q02833 373 aa28.86■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 KSR2Q6VAB6 950 aa28.86■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.86■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 NLRP3Q96P20 1036 aa28.86■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 MYD88Q99836 296 aa28.86■■■□□ 2.21
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CCDC189-211ENST00000545825 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.86■■■□□ 2.21
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CCDC189-211ENST00000545825 NFKBIEO00221 500 aa28.85■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 ALDH1B1P30837 517 aa28.85■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 SLFN5Q08AF3 891 aa28.85■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.85■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.85■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 FLIIQ13045 1269 aa28.84■■■□□ 2.21
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CCDC189-211ENST00000545825 FAM89AQ96GI7 184 aa28.83■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.83■■■□□ 2.21
CCDC189-211ENST00000545825 SOGA3Q5TF21 947 aa28.82■■■□□ 2.2
CCDC189-211ENST00000545825 SBF1O95248 1867 aa28.81■■■□□ 2.2
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.81■■■□□ 2.2
CCDC189-211ENST00000545825 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
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CCDC189-211ENST00000545825 RNF181Q9P0P0 153 aa28.81■■■□□ 2.2
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CCDC189-211ENST00000545825 LAMB2P55268 1798 aa28.8■■■□□ 2.2
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CCDC189-211ENST00000545825 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CCDC189-211ENST00000545825 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
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CCDC189-211ENST00000545825 IGKV5-2P06315 115 aa28.78■■■□□ 2.2
CCDC189-211ENST00000545825 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC93Q567U6 631 aa28.78■■■□□ 2.2
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CCDC189-211ENST00000545825 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.77■■■□□ 2.2
CCDC189-211ENST00000545825 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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CCDC189-211ENST00000545825 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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CCDC189-211ENST00000545825 SNED1Q8TER0 1413 aa28.74■■■□□ 2.19
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CCDC189-211ENST00000545825 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
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CCDC189-211ENST00000545825 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CCDC189-211ENST00000545825 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.71■■■□□ 2.19
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CCDC189-211ENST00000545825 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
CCDC189-211ENST00000545825 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.7■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 F6X3S4 739 aa28.69■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.69■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.69■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.69■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 BBOX1O75936 387 aa28.68■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 GRAPQ13588 217 aa28.68■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 LINS1Q8NG48 757 aa28.68■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 GCKRQ14397 625 aa28.67■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.67■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 PDE8AO60658 829 aa28.66■■■□□ 2.18
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