RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 PIM2Q9P1W9 311 aa23.53■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 LAMB2P55268 1798 aa23.52■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.52■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 H0YIN7 160 aa23.52■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.52■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.52■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.52■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 UTRNP46939 3433 aa23.51■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 GRIN3BO60391 1043 aa23.51■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.51■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.51■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.5■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 ERFEQ4G0M1 354 aa23.5■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 CHD4Q14839 1912 aa23.49■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 SRGNP10124 158 aa23.49■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.49■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 MYD88Q99836 296 aa23.49■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.49■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.48■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 CRY2Q49AN0 593 aa23.48■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.48■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 STYK1Q6J9G0 422 aa23.48■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 MASTLQ96GX5 879 aa23.48■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.47■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.47■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 BCS1LQ9Y276 419 aa23.47■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 NPR1P16066 1061 aa23.46■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 CACNA1SQ13698 1873 aa23.46■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 TTLL6Q8N841 843 aa23.46■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.46■■□□□ 1.35
COPS7A-216ENST00000543170 CNKSR1Q969H4 720 aa23.45■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.45■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 PTPRCP08575 1304 aa23.44■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 IGKV5-2P06315 115 aa23.44■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 NLRP3Q96P20 1036 aa23.43■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 SLX4Q8IY92 1834 aa23.43■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.42■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 LINS1Q8NG48 757 aa23.42■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.42■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 FAM89AQ96GI7 184 aa23.41■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.4■■□□□ 1.34
COPS7A-216ENST00000543170 ALDH1B1P30837 517 aa23.39■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 SYNE4Q8N205 404 aa23.39■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.39■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 MYH3P11055 1940 aa23.39■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 F6X3S4 739 aa23.38■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 BEND3Q5T5X7 828 aa23.38■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.38■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.37■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 GCKRQ14397 625 aa23.37■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.37■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 KIF16BQ96L93 1317 aa23.36■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 SOGA3Q5TF21 947 aa23.36■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 H7C1W4 665 aa23.34■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 PDE8AO60658 829 aa23.34■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 ALDH1L1O75891 902 aa23.34■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.34■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.33■■□□□ 1.33
COPS7A-216ENST00000543170 ABCC4O15439 1325 aa23.33■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 SBF1O95248 1867 aa23.32■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 C21orf2O43822 256 aa23.32■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.32■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.32■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 SNED1Q8TER0 1413 aa23.32■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 CASP7P55210 303 aa23.31■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.31■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.31■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.31■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.31■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.3■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 GRAPQ13588 217 aa23.3■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC93Q567U6 631 aa23.3■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
COPS7A-216ENST00000543170 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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