RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 FOSL1P15407 271 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 VCAM1P19320 739 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 IGBP1P78318 339 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 TRIM29Q14134 588 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 BHMTQ93088 406 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 MPP4Q96JB8 637 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.28□□□□□ -1.24
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LMO3-225ENST00000541295 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 C4orf46Q504U0 113 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 TMX1Q9H3N1 280 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 TIMM44O43615 452 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 CDKL5O76039 1030 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 PPP2R1AP30153 589 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 RWDD2BP57060 319 aa7.28□□□□□ -1.24
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LMO3-225ENST00000541295 SOGA3Q5TF21 947 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 ITM2BQ9Y287 266 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.27□□□□□ -1.24
LMO3-225ENST00000541295 NUTM2FA1L443 756 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 MAP9Q49MG5 647 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.27□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 UBXN4Q92575 508 aa7.27□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 TPPPO94811 219 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 TRPC1P48995 793 aa7.26□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 TAF4BQ92750 862 aa7.26□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.26□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 MYOM1P52179 1685 aa7.26□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 TCF3P15923 654 aa7.25□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 EID1Q9Y6B2 187 aa7.25□□□□□ -1.25
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LMO3-225ENST00000541295 DBN1Q16643 649 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 TRIM11Q96F44 468 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 CDK19Q9BWU1 502 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 FLIIQ13045 1269 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 AGAP3Q96P47 875 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 METP08581 1390 aa7.24□□□□□ -1.25
LMO3-225ENST00000541295 LTKP29376 864 aa7.24□□□□□ -1.25
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