RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534404.1

LRP4-205, Transcript of LDL receptor related protein 4, human

TSL 5

Gene LRP4, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP4-205	ENST00000534404	IL16	Q14005	1332 aa		42.66	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		42.65	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		42.65	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	NLRP10	Q86W26	655 aa		42.65	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	CRY2	Q49AN0	593 aa		42.64	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		42.64	■■■■■ 4.42
LRP4-205	ENST00000534404	TSPYL6	Q8N831	410 aa		42.63	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	NLRP3	Q96P20	1036 aa		42.63	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		42.63	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		42.63	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	PRELP	P51888	382 aa		42.62	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	GOLGA2	Q08379	1002 aa		42.61	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC93	Q567U6	631 aa		42.61	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		42.61	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		42.61	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		42.6	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	WDR63	Q8IWG1	891 aa		42.59	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		42.59	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	42.59	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF428	Q96B54	188 aa		42.58	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LRP4-205	ENST00000534404	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		42.56	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		42.55	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		42.55	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		42.55	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	KIF3C	O14782	793 aa		42.55	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	STK31	Q9BXU1	1019 aa		42.55	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		42.54	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	OLFM4	Q6UX06	510 aa		42.53	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		42.53	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		42.53	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		42.51	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	SYNE4	Q8N205	404 aa		42.51	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		42.51	■■■■■ 4.4
LRP4-205	ENST00000534404	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		42.49	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	42.49	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	MYD88	Q99836	296 aa		42.47	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	RRAGC	Q9HB90	399 aa		42.47	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	GLTPD2	A6NH11	291 aa		42.46	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		42.46	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	FAM89A	Q96GI7	184 aa		42.46	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		42.45	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
LRP4-205	ENST00000534404	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	42.44	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	SLC4A2	P04920	1241 aa		42.42	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		42.42	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	TOMM70	O94826	608 aa		42.41	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		42.4	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	ABCC4	O15439	1325 aa		42.4	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
LRP4-205	ENST00000534404	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		42.38	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	KSR2	Q6VAB6	950 aa		42.37	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	LAMB2	P55268	1798 aa		42.37	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		42.36	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		42.36	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		42.36	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	PSMD1	Q99460	953 aa		42.36	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	42.35	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	VAMP4	O75379	141 aa		42.34	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	BBOX1	O75936	387 aa		42.34	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	G2E3	Q7L622	706 aa		42.33	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		42.33	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		42.32	■■■■■ 4.37
LRP4-205	ENST00000534404	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	GRAP	Q13588	217 aa		42.31	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	CCER2	I3L3R5	266 aa		42.29	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	SLC51A	Q86UW1	340 aa		42.29	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	JDP2	Q8WYK2	163 aa		42.29	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	SNED1	Q8TER0	1413 aa		42.29	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	FLII	Q13045	1269 aa		42.28	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	SP8	Q8IXZ3	490 aa		42.27	■■■■■ 4.36
LRP4-205	ENST00000534404	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36

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