RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	GNAI1	P63096	354 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	32.41	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	ANP32C	O43423	234 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	APLP1	P51693	650 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	FSTL1	Q12841	308 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	SYNE4	Q8N205	404 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPRJ-206	ENST00000534219	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	POTEC	B2RU33	542 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	PSMD1	Q99460	953 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTPRJ-206	ENST00000534219	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	ABCC4	O15439	1325 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	WDR90	Q96KV7	1748 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	HTRA3	P83110	453 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM89A	Q96GI7	184 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	SNED1	Q8TER0	1413 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	BBOX1	O75936	387 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PTPRJ-206	ENST00000534219	FZD9	O00144	591 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	GRAP	Q13588	217 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYD88	Q99836	296 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	GPC2	Q8N158	579 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRJ-206	ENST00000534219	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PTPRJ-206	ENST00000534219	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PTPRJ-206	ENST00000534219	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTPRJ-206	ENST00000534219	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTPRJ-206	ENST00000534219	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTPRJ-206	ENST00000534219	IL16	Q14005	1332 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PTPRJ-206	ENST00000534219	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PTPRJ-206	ENST00000534219	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PTPRJ-206	ENST00000534219	MPND	Q8N594	471 aa		32.12	■■■□□ 2.73

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