RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 PDE6BP35913 854 aa14.76□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF428Q96B54 188 aa14.76□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP10DQ9P241 1426 aa14.75□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.75□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 RGL2O15211 777 aa14.75□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.75□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.75□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 NYXQ9GZU5 481 aa14.75□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.74□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 CHADLQ6NUI6 762 aa14.74□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.74□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.74□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.74□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.74□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNA3P22001 575 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ERFEQ4G0M1 354 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PARP10Q53GL7 1025 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 SUSD4Q5VX71 490 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.72□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TCIRG1Q13488 830 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TTLL6Q8N841 843 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.71□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ABCC12Q96J65 1359 aa14.71□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 HAX1O00165 279 aa14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 CACNA1FO60840 1977 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 E9PSI1 815 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 NTSR2O95665 410 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 MASTLQ96GX5 879 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 MYD88Q99836 296 aa14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF521Q96K83 1311 aa14.68□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 NLRP10Q86W26 655 aa14.68□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 CNKSR1Q969H4 720 aa14.68□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.68□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 VAMP4O75379 141 aa14.67□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 SRGNP10124 158 aa14.67□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 NPR1P16066 1061 aa14.67□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 STYK1Q6J9G0 422 aa14.67□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.66□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 SLX4Q8IY92 1834 aa14.66□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 C21orf2O43822 256 aa14.66□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.66□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 G2E3Q7L622 706 aa14.66□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.66□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 FLIIQ13045 1269 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 KSR2Q6VAB6 950 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM89AQ96GI7 184 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 NLRP3Q96P20 1036 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 LAMB2P55268 1798 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 RASSF7Q02833 373 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 SLFN5Q08AF3 891 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 SYNE4Q8N205 404 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 ADCY9O60503 1353 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 ALDH1B1P30837 517 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF181Q9P0P0 153 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 SOGA3Q5TF21 947 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 CRY2Q49AN0 593 aa14.61□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.61□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.61□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 SBF1O95248 1867 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms