RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PTPRK-222	ENST00000532751	ABCC12	Q96J65	1359 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	SRGN	P10124	158 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	STYK1	Q6J9G0	422 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	CNKSR1	Q969H4	720 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	NPR1	P16066	1061 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	KSR2	Q6VAB6	950 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	MYD88	Q99836	296 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	FLII	Q13045	1269 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	G2E3	Q7L622	706 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.08	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	UTRN	P46939	3433 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRK-222	ENST00000532751	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	ADCY9	O60503	1353 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	LAMB2	P55268	1798 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PTPRK-222	ENST00000532751	C21orf2	O43822	256 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	SYNE4	Q8N205	404 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	SBF1	O95248	1867 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	IGKV5-2	P06315	115 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTPRK-222	ENST00000532751	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC93	Q567U6	631 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	LINS1	Q8NG48	757 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	RASSF7	Q02833	373 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751		F6X3S4	739 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	MYH3	P11055	1940 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	NFKBIE	O00221	500 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	ABCC4	O15439	1325 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	PTPRC	P08575	1304 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	PDE8A	O60658	829 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	LMNB1	P20700	586 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	GCKR	Q14397	625 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRK-222	ENST00000532751	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PTPRK-222	ENST00000532751	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRK-222	ENST00000532751	TAF1	P21675	1872 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRK-222	ENST00000532751	GRAP	Q13588	217 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRK-222	ENST00000532751	BEND3	Q5T5X7	828 aa		27.88	■■■□□ 2.05

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