RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 OIP5O43482 229 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 ADH6P28332 368 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 COX20Q5RI15 118 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 C16orf46Q6P387 395 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 EPB42P16452 691 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 IDH3AP50213 366 aa6.8□□□□□ -1.32
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PTPRC-214ENST00000530727 CARNS1A5YM72 827 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 SLC30A3Q99726 388 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRC-214ENST00000530727 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRC-214ENST00000530727 SYT9Q86SS6 491 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 AMPD1P23109 780 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRC-214ENST00000530727 USTQ9Y2C2 406 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 EPXP11678 715 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 INPP5BP32019 993 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 SEPT3Q9UH03 358 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 CCINQ13939 588 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 OPLAHO14841 1288 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 RETREG2Q8NC44 543 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 BTBD6Q96KE9 485 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 GSX2Q9BZM3 304 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 EFCC1Q9HA90 598 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 USP20Q9Y2K6 914 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 CHSY3Q70JA7 882 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 ABTB2Q8N961 1025 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 ELOA3Q8NG57 546 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 IGFLR1Q9H665 355 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 MTMR7Q9Y216 660 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 NFKB1P19838 968 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 ZAP70P43403 619 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRC-214ENST00000530727 HELQQ8TDG4 1101 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 WIZO95785 1651 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 ADH7P40394 386 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-214ENST00000530727 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.71□□□□□ -1.33
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