RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524349.5

RPS20-211, Transcript of ribosomal protein S20, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS20, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS20-211	ENST00000524349	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	SYNE4	Q8N205	404 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	CRY2	Q49AN0	593 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	KIF3C	O14782	793 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	ALDH1B1	P30837	517 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	IL16	Q14005	1332 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	CCDC93	Q567U6	631 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS20-211	ENST00000524349	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	SOGA3	Q5TF21	947 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	SBF1	O95248	1867 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
RPS20-211	ENST00000524349	FAM89A	Q96GI7	184 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	MYD88	Q99836	296 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	RRAGC	Q9HB90	399 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	32.55	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	ABCC4	O15439	1325 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	GLTPD2	A6NH11	291 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	G2E3	Q7L622	706 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPS20-211	ENST00000524349	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	SLC4A2	P04920	1241 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	VAMP4	O75379	141 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	SNED1	Q8TER0	1413 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	TOMM70	O94826	608 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPS20-211	ENST00000524349	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	LAMB2	P55268	1798 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	GRAP	Q13588	217 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	PSMD1	Q99460	953 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	FLII	Q13045	1269 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	BBOX1	O75936	387 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RPS20-211	ENST00000524349	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RPS20-211	ENST00000524349	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RPS20-211	ENST00000524349	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RPS20-211	ENST00000524349	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RPS20-211	ENST00000524349	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77

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