RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 TSC1Q92574 1164 aa25.7■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 ALDH1L1O75891 902 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 SASH1O94885 1247 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 MAP4K1Q92918 833 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 KAZALD1Q96I82 304 aa25.68■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 SUCLG2Q96I99 432 aa25.68■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 TTC6Q86TZ1 520 aa25.68■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.68■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.68■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC27A2O14975 620 aa25.67■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 SIL1Q9H173 461 aa25.67■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.67■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 A0A0D9SFI3 127 aa25.66■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 CAMK4Q16566 473 aa25.66■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 SPC24Q8NBT2 197 aa25.66■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 GRM8O00222 908 aa25.65■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.65■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 LTN1O94822 1766 aa25.65■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC192P0DO97 292 aa25.64■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 KRT85P78386 507 aa25.64■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.64■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.64■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.64■■□□□ 1.7
TMEM200B-202ENST00000521452 LIG1P18858 919 aa25.64■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.64■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.63■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 FSD1Q9BTV5 496 aa25.63■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 PSMA5P28066 241 aa25.63■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 LINS1Q8NG48 757 aa25.63■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 PSME1Q06323 249 aa25.62■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.62■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.62■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 PXDNQ92626 1479 aa25.61■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM177BA6PVY3 158 aa25.61■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 HIP1O00291 1037 aa25.61■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 STK3Q13188 491 aa25.61■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.61■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 USP54Q70EL1 1684 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 NFAT5O94916 1531 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 MAP3K11Q16584 847 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 RPS6KB1P23443 525 aa25.59■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 RNF20Q5VTR2 975 aa25.59■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 LUZP1Q86V48 1076 aa25.59■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.59■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.59■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 PDCP20941 246 aa25.58■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.58■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 DACT1Q9NYF0 836 aa25.58■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.58■■□□□ 1.69
TMEM200B-202ENST00000521452 TYRO3Q06418 890 aa25.58■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.58■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 KLHL34Q8N239 644 aa25.58■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 SNRKQ9NRH2 765 aa25.58■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 IGKV5-2P06315 115 aa25.57■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.57■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 ELP1O95163 1332 aa25.57■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 UTYO14607 1347 aa25.56■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKRD1Q15327 319 aa25.56■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.56■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 SPATA32Q96LK8 384 aa25.56■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 TNMDQ9H2S6 317 aa25.56■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 PDIA6Q15084 440 aa25.55■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 MED23Q9ULK4 1368 aa25.55■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.55■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.54■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.54■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 GCP02774 474 aa25.54■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.54■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF3AQ9Y496 699 aa25.54■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 JAK2O60674 1132 aa25.53■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 MYL6BP14649 208 aa25.53■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 PTGS1P23219 599 aa25.53■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.53■■□□□ 1.68
TMEM200B-202ENST00000521452 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
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