RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520712.1

CLVS1-206, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLVS1, Length 661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-206ENST00000520712 BRD7Q9NPI1 651 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 OIP5O43482 229 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 ARHGEF15O94989 841 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 NEUROD1Q13562 356 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 EFCC1Q9HA90 598 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 STRN4Q9NRL3 753 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 KLK14Q9P0G3 267 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 EPB42P16452 691 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 IRS1P35568 1242 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 TYRO3Q06418 890 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 COX20Q5RI15 118 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 C16orf46Q6P387 395 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 IFT43Q96FT9 208 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 GGA1Q9UJY5 639 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 BCS1LQ9Y276 419 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 MICAL2O94851 1124 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 ADH6P28332 368 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 HCN2Q9UL51 889 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 USTQ9Y2C2 406 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 SSFA2P28290 1259 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 INPP5BP32019 993 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 IDH3AP50213 366 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 SLAIN2Q9P270 581 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-206ENST00000520712 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ALAS2P22557 587 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ARSDP51689 593 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SPEM2Q0P670 501 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 KANK3Q6NY19 840 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 MTMR7Q9Y216 660 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 CARNS1A5YM72 827 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SIN3BO75182 1162 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 CCINQ13939 588 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SYT9Q86SS6 491 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 TREML1Q86YW5 311 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SLC30A3Q99726 388 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 OPLAHO14841 1288 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ADAM23O75077 832 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 EPXP11678 715 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 BTBD6Q96KE9 485 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PNMA5Q96PV4 448 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 GSX2Q9BZM3 304 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 STIM2Q9P246 746 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 KLF15Q9UIH9 416 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 AMPD1P23109 780 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ABTB2Q8N961 1025 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 GRIN2CQ14957 1233 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PODNQ7Z5L7 613 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ELOA3Q8NG57 546 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 TNFRSF25Q93038 417 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 BHMTQ93088 406 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SEPT3Q9UH03 358 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PIK3R2O00459 728 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 BRD1O95696 1058 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 PCSK7Q16549 785 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 RRAGCQ9HB90 399 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-206ENST00000520712 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-206ENST00000520712 TNFRSF10BO14763 440 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-206ENST00000520712 MSTNO14793 375 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-206ENST00000520712 EGFRP00533 1210 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-206ENST00000520712 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms