RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SSH3Q8TE77 659 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 SUCLG2Q96I99 432 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 CERS3Q8IU89 383 aa9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 CEP120Q8N960 986 aa9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 PXDNQ92626 1479 aa9.4□□□□□ -0.9
TRPS1-208ENST00000519076 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
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TRPS1-208ENST00000519076 GCKRQ14397 625 aa9.4□□□□□ -0.9
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TRPS1-208ENST00000519076 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.39□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.39□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.39□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 NGLY1Q96IV0 654 aa9.39□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.39□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.39□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 NCAPD2Q15021 1401 aa9.38□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 ADCY9O60503 1353 aa9.38□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.38□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.38□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 CHMLP26374 656 aa9.38□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 FSD2A1L4K1 749 aa9.37□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 TOM1O60784 492 aa9.37□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.37□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 DCCP43146 1447 aa9.37□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.36□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 MRE11P49959 708 aa9.36□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 TFCP2Q12800 502 aa9.35□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 SNX21Q969T3 373 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.35□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 WASHC4Q2M389 1173 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 RNF20Q5VTR2 975 aa9.34□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 EVI5LQ96CN4 794 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
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TRPS1-208ENST00000519076 TIMM10P62072 90 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 POLA2Q14181 598 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 PDIA6Q15084 440 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 PIGBQ92521 554 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 HIP1O00291 1037 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 SSFA2P28290 1259 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 SNRKQ9NRH2 765 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-208ENST00000519076 ATP6V1AP38606 617 aa9.33□□□□□ -0.92
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