RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 SYNE4Q8N205 404 aa18.2■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.2■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.2■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.19■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 LMNB1P20700 586 aa18.19■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.19■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 OLFM4Q6UX06 510 aa18.18■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.18■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 ALDH1B1P30837 517 aa18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 GOLGA2Q08379 1002 aa18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.17■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 SOGA3Q5TF21 947 aa18.16■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 NLRP3Q96P20 1036 aa18.16■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 SLX4Q8IY92 1834 aa18.16■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 C1QTNF8P60827 252 aa18.15■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.15■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.15■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.15■□□□□ 0.5
PDGFRB-202ENST00000517488 CCER2I3L3R5 266 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 VAMP4O75379 141 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC93Q567U6 631 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC51AQ86UW1 340 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 STK31Q9BXU1 1019 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF521Q96K83 1311 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.14■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF3CO14782 793 aa18.13■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 G2E3Q7L622 706 aa18.13■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM89AQ96GI7 184 aa18.13■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.13■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 MYD88Q99836 296 aa18.13■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.13■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC4A2P04920 1241 aa18.12■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.12■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.11■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.11■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCC4O15439 1325 aa18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 KSR2Q6VAB6 950 aa18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 SBF1O95248 1867 aa18.08■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.08■□□□□ 0.49
PDGFRB-202ENST00000517488 GLTPD2A6NH11 291 aa18.08■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.08■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.08■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 SNED1Q8TER0 1413 aa18.07■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.07■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 IGKV5-2P06315 115 aa18.07■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 FLIIQ13045 1269 aa18.07■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 RRAGCQ9HB90 399 aa18.07■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.06■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 BBOX1O75936 387 aa18.06■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 PSMD1Q99460 953 aa18.06■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.06■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.06■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 GRAPQ13588 217 aa18.05■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 CACNA1SQ13698 1873 aa18.04■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 MIER1Q8N108 512 aa18.04■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 E9PSI1 815 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 SP8Q8IXZ3 490 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.03■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 TOMM70O94826 608 aa18.02■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 SLFN5Q08AF3 891 aa18.02■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.02■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.02■□□□□ 0.48
PDGFRB-202ENST00000517488 POTECB2RU33 542 aa18.01■□□□□ 0.47
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