RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517164.1

RNU6-1028P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1028, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1028P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 POLIQ9UNA4 740 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PDGFAP04085 211 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MAPK1P28482 360 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SV2AQ7L0J3 742 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 EPB42P16452 691 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 KCNQ4P56696 695 aa8.27□□□□□ -1.09
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 PHF24Q9UPV7 400 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PCSK2P16519 638 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C8orf34Q49A92 452 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMC7Q7Z402 723 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMC1Q8TDI8 760 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ASB16Q96NS5 453 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ERBB4Q15303 1308 aa8.25□□□□□ -1.09
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 VSIG8P0DPA2 414 aa8.24□□□□□ -1.09
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 GAS6Q14393 721 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CITED4Q96RK1 184 aa8.24□□□□□ -1.09
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 GPR182O15218 404 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGHA2P01877 340 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SPEM2Q0P670 501 aa8.23□□□□□ -1.09
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 MX2P20592 715 aa8.21□□□□□ -1.1
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TREHO43280 583 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 BMP4P12644 408 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NFKB1P19838 968 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RGS22Q8NE09 1264 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 BHMTQ93088 406 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PNMA5Q96PV4 448 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ELP3Q9H9T3 547 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MBIPQ9NS73 344 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZFATQ9P243 1243 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KRT76Q01546 638 aa8.18□□□□□ -1.1
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