RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 SIRT1Q96EB6 747 aa6.19□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.19□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 EML1O00423 815 aa6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 WNT11O96014 354 aa6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 BRD7Q9NPI1 651 aa6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 NAGPAQ9UK23 515 aa6.18□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 ALX3O95076 343 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 GRIK1P39086 918 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 KCNQ4P56696 695 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 FBLN7Q53RD9 439 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 DTX1Q86Y01 620 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 RAXQ9Y2V3 346 aa6.17□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.16□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 CEP63Q96MT8 703 aa6.16□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.15□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 APBB1O00213 710 aa6.15□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 IRF5Q13568 498 aa6.15□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.15□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ATXN3-211ENST00000511362 DLL1O00548 723 aa6.14□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 GRIK5Q16478 980 aa6.14□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.14□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 STOML1Q9UBI4 398 aa6.14□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 TEAD4Q15561 434 aa6.13□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.13□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.13□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 F8W735 103 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 NOS2P35228 1153 aa6.12□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 VAC14Q08AM6 782 aa6.12□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.12□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 ABI1Q8IZP0 508 aa6.12□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.12□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.12□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.12□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 PRR19A6NJB7 356 aa6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 SFI1A8K8P3 1242 aa6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 ABL2P42684 1182 aa6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 TYRO3Q06418 890 aa6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 ASIC4Q96FT7 647 aa6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.11□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 PLAURQ03405 335 aa6.1□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 NFIAQ12857 509 aa6.1□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 MCM6Q14566 821 aa6.1□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 Q6ZS46 218 aa6.1□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 FAM35AQ86V20 835 aa6.1□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 CPB1P15086 417 aa6.09□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 GLB1P16278 677 aa6.09□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.09□□□□□ -1.43
ATXN3-211ENST00000511362 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.08□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 EFCC1Q9HA90 598 aa6.08□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.08□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.08□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.07□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.07□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 COG6Q9Y2V7 657 aa6.07□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 SERTM1A2A2V5 107 aa6.06□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 BACH1O14867 736 aa6.06□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 TBCELQ5QJ74 424 aa6.06□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 PERM1Q5SV97 790 aa6.06□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.06□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 POM121Q96HA1 1249 aa6.06□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 NFKB1P19838 968 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 RNF43Q68DV7 783 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 CBLL1Q75N03 491 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 PNMA5Q96PV4 448 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 GSX2Q9BZM3 304 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.05□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 DBX1A6NMT0 343 aa6.04□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 WASHC4Q2M389 1173 aa6.04□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.04□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.04□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 TTC9Q92623 222 aa6.04□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 SUSD3Q96L08 255 aa6.04□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 HMX2A2RU54 273 aa6.03□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 ITGB5P18084 799 aa6.03□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 SEMA3FQ13275 785 aa6.03□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF124Q15973 351 aa6.03□□□□□ -1.44
ATXN3-211ENST00000511362 PCSK7Q16549 785 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms