RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC51AQ86UW1 340 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP10Q86W26 655 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 HYPKQ9NX55 129 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 MYH3P11055 1940 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TCIRG1Q13488 830 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP10Q53GL7 1025 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SPEF2Q9C093 1822 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 NPR1P16066 1061 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CRY2Q49AN0 593 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 OLFM4Q6UX06 510 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNE4Q8N205 404 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CNKSR1Q969H4 720 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF181Q9P0P0 153 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SNED1Q8TER0 1413 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF521Q96K83 1311 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR63Q8IWG1 891 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA2Q08379 1002 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 G2E3Q7L622 706 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 COL4A5P29400 1685 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 CCER2I3L3R5 266 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 LMNB1P20700 586 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 MYD88Q99836 296 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 LTBP1Q14766 1721 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 STK31Q9BXU1 1019 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC4O15439 1325 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR90Q96KV7 1748 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC93Q567U6 631 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM89AQ96GI7 184 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 VAMP4O75379 141 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP3Q96P20 1036 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF3CO14782 793 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC4A2P04920 1241 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH1B1P30837 517 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 SOGA3Q5TF21 947 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 FLIIQ13045 1269 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 MIER1Q8N108 512 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV5-2P06315 115 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KSR2Q6VAB6 950 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GUL6 1792 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 C1QTNF8P60827 252 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP4AQ9BY43 222 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SCN4AP35499 1836 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GRAPQ13588 217 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
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