RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510032.5

FAM200B-215, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 2

Gene FAM200B, Length 639 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-215	ENST00000510032	NPR1	P16066	1061 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	ABCC12	Q96J65	1359 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.74	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	FLII	Q13045	1269 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	MYD88	Q99836	296 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	G2E3	Q7L622	706 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FAM200B-215	ENST00000510032	CRY2	Q49AN0	593 aa		28.7	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.69	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.69	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.69	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	ADCY9	O60503	1353 aa		28.68	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.67	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.66	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.65	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		28.64	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	CHD4	Q14839	1912 aa		28.64	■■■□□ 2.18
FAM200B-215	ENST00000510032	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.63	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	C21orf2	O43822	256 aa		28.63	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.62	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.61	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		28.61	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.61	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	IGKV5-2	P06315	115 aa		28.6	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		28.59	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	LINS1	Q8NG48	757 aa		28.59	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.58	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.58	■■■□□ 2.17
FAM200B-215	ENST00000510032	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.57	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.57	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	PTPRC	P08575	1304 aa		28.56	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.56	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032		F6X3S4	739 aa		28.55	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.55	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		28.54	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	GCKR	Q14397	625 aa		28.54	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.54	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		28.54	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.54	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	NFKBIE	O00221	500 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	PDE8A	O60658	829 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	LMNB1	P20700	586 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	RASSF7	Q02833	373 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	RNF181	Q9P0P0	153 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	ABCC4	O15439	1325 aa		28.52	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		28.52	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	BBOX1	O75936	387 aa		28.52	■■■□□ 2.16
FAM200B-215	ENST00000510032	GRAP	Q13588	217 aa		28.51	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	BEND3	Q5T5X7	828 aa		28.51	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		28.51	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		28.5	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		28.5	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032		H7C1W4	665 aa		28.49	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.49	■■■□□ 2.15
FAM200B-215	ENST00000510032	ALDH1L1	O75891	902 aa		28.48	■■■□□ 2.15

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