RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 NLRP10Q86W26 655 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 SOGA3Q5TF21 947 aa30.4■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 ZNF521Q96K83 1311 aa30.4■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 SLX4Q8IY92 1834 aa30.4■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 ALDH1B1P30837 517 aa30.39■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 CRY2Q49AN0 593 aa30.39■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 CACNA1FO60840 1977 aa30.39■■■□□ 2.46
PITX1-206ENST00000507253 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 C21orf2O43822 256 aa30.37■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 NLRP3Q96P20 1036 aa30.37■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 ISCA1Q9BUE6 129 aa30.37■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 SH3TC1Q8TE82 1336 aa30.37■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 SBF1O95248 1867 aa30.37■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 SLC10A5Q5PT55 438 aa30.36■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.36■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.35■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa30.33■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 VAMP4O75379 141 aa30.33■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 RASSF7Q02833 373 aa30.33■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 RNF181Q9P0P0 153 aa30.33■■■□□ 2.45
PITX1-206ENST00000507253 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 SLC4A2P04920 1241 aa30.32■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 LAMB2P55268 1798 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 LMNB1P20700 586 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 CCDC93Q567U6 631 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 KSR2Q6VAB6 950 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 MYD88Q99836 296 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 LTBP3Q9NS15 1303 aa30.3■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 E9PSI1 815 aa30.3■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 NFKBIEO00221 500 aa30.3■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.29■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.29■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa30.29■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.29■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 CCDC191Q8NCU4 936 aa30.28■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.28■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.27■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 NEXNQ0ZGT2 675 aa30.27■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 MIER1Q8N108 512 aa30.27■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.27■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.27■■■□□ 2.44
PITX1-206ENST00000507253 FLIIQ13045 1269 aa30.26■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.26■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa30.25■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.25■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 FAM89AQ96GI7 184 aa30.25■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 G2E3Q7L622 706 aa30.24■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 SYNE4Q8N205 404 aa30.24■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.23■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 ZNF428Q96B54 188 aa30.22■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 SLFN5Q08AF3 891 aa30.21■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 ABCC4O15439 1325 aa30.21■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
PITX1-206ENST00000507253 KDM2BQ8NHM5 1336 aa30.2■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 PRELPP51888 382 aa30.19■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 BBOX1O75936 387 aa30.17■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.17■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 IGKV5-2P06315 115 aa30.16■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 GRAPQ13588 217 aa30.16■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 OLFM4Q6UX06 510 aa30.16■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 SNED1Q8TER0 1413 aa30.15■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 TMC4Q7Z404 712 aa30.15■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 PSMD1Q99460 953 aa30.15■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 NEURL1BA8MQ27 555 aa30.14■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.14■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 CDHR2Q9BYE9 1310 aa30.14■■■□□ 2.42
PITX1-206ENST00000507253 PDE8AO60658 829 aa30.13■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.13■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 LINS1Q8NG48 757 aa30.12■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 210.7 ms