RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 HLFQ16534 295 aa25.43■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 ABCC4O15439 1325 aa25.42■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.42■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 NFIXQ14938 502 aa25.42■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.42■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 MYD88Q99836 296 aa25.42■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 TNNQ9UQP3 1299 aa25.42■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.41■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 TCIRG1Q13488 830 aa25.4■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 PDE3AQ14432 1141 aa25.4■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 KCNA3P22001 575 aa25.39■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 C1QTNF8P60827 252 aa25.39■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 LINS1Q8NG48 757 aa25.38■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 PANK1Q8TE04 598 aa25.38■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.38■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 PIM2Q9P1W9 311 aa25.38■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.38■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.37■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 GPTP24298 496 aa25.37■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 CHRNA5P30532 468 aa25.36■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 BEND3Q5T5X7 828 aa25.36■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.36■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 ALDH1L1O75891 902 aa25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 SERPINB2P05120 415 aa25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 RLBP1P12271 317 aa25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.34■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 IGKV5-2P06315 115 aa25.34■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 PARP10Q53GL7 1025 aa25.34■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.34■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.34■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 SETDB2Q96T68 719 aa25.34■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.33■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.32■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.31■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 NLRP10Q86W26 655 aa25.31■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 COG6Q9Y2V7 657 aa25.31■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.31■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.3■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 NEFLP07196 543 aa25.29■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 GCKRQ14397 625 aa25.29■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.29■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 FAM177BA6PVY3 158 aa25.28■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 SBF1O95248 1867 aa25.28■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 NPHP1O15259 732 aa25.27■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 NYXQ9GZU5 481 aa25.27■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SMIM20-201ENST00000506197 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 GRM8O00222 908 aa25.26■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 SUSD4Q5VX71 490 aa25.26■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.25■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 CRBNQ96SW2 442 aa25.25■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 LAMB2P55268 1798 aa25.24■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 MYH3P11055 1940 aa25.24■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 CEP350Q5VT06 3117 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 H0YIN7 160 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 NTSR2O95665 410 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 GNAI3P08754 354 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 USP44Q9H0E7 712 aa25.23■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 CNBD1Q8NA66 436 aa25.22■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 MEIS3Q99687 375 aa25.22■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.22■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 H7C1W4 665 aa25.21■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 TTLL6Q8N841 843 aa25.21■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 FAM89AQ96GI7 184 aa25.21■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.21■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 CACNA1SQ13698 1873 aa25.21■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SMIM20-201ENST00000506197 UTYO14607 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms