RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 NLRP10Q86W26 655 aa27.09■■□□□ 1.93
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SH3BP2-210ENST00000505941 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-210ENST00000505941 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2-210ENST00000505941 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
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SH3BP2-210ENST00000505941 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.05■■□□□ 1.92
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SH3BP2-210ENST00000505941 ABCC12Q96J65 1359 aa27.04■■□□□ 1.92
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SH3BP2-210ENST00000505941 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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SH3BP2-210ENST00000505941 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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SH3BP2-210ENST00000505941 E9PSI1 815 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.98■■□□□ 1.91
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SH3BP2-210ENST00000505941 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF428Q96B54 188 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM89AQ96GI7 184 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF521Q96K83 1311 aa26.96■■□□□ 1.91
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SH3BP2-210ENST00000505941 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.93■■□□□ 1.9
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SH3BP2-210ENST00000505941 BBOX1O75936 387 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-210ENST00000505941 G2E3Q7L622 706 aa26.92■■□□□ 1.9
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SH3BP2-210ENST00000505941 GRAPQ13588 217 aa26.86■■□□□ 1.89
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SH3BP2-210ENST00000505941 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-210ENST00000505941 IGKV5-2P06315 115 aa26.84■■□□□ 1.89
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SH3BP2-210ENST00000505941 SP8Q8IXZ3 490 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-210ENST00000505941 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-210ENST00000505941 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-210ENST00000505941 LINS1Q8NG48 757 aa26.83■■□□□ 1.89
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