RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OLFM4Q6UX06 510 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF853P0CG23 659 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNAI1P63096 354 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFT57Q9NWB7 429 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIC1Q4ADV7 1423 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCIRG1Q13488 830 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLRP3Q96P20 1036 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP350Q5VT06 3117 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANP32CO43423 234 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APLP1P51693 650 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FSTL1Q12841 308 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLRP10Q86W26 655 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HYPKQ9NX55 129 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC10A5Q5PT55 438 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYNE4Q8N205 404 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRS2Q9HD23 443 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR90Q96KV7 1748 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POTECB2RU33 542 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF428Q96B54 188 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3TC1Q8TE82 1336 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMD1Q99460 953 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ISCA1Q9BUE6 129 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA2Q08379 1002 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC27Q2M243 656 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JDP2Q8WYK2 163 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WWC1Q8IX03 1113 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC4O15439 1325 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAMB2P55268 1798 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNED1Q8TER0 1413 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC51AQ86UW1 340 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM89AQ96GI7 184 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BBOX1O75936 387 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPYL6Q8N831 410 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FZD9O00144 591 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HTRA3P83110 453 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRAPQ13588 217 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SP8Q8IXZ3 490 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYD88Q99836 296 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCN4AP35499 1836 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL16Q14005 1332 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHADLQ6NUI6 762 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPIP5K2O43314 1243 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POTEIP0CG38 1075 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POTEJP0CG39 1038 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPC2Q8N158 579 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPNDQ8N594 471 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STK31Q9BXU1 1019 aa30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms