RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TCIRG1Q13488 830 aa17.03■□□□□ 0.32
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PGGT1B-204ENST00000503638 ST5P78524 1137 aa17.02■□□□□ 0.32
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PGGT1B-204ENST00000503638 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
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PGGT1B-204ENST00000503638 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
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PGGT1B-204ENST00000503638 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.9■□□□□ 0.3
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PGGT1B-204ENST00000503638 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
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PGGT1B-204ENST00000503638 PLIN1O60240 522 aa16.89■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 TNNQ9UQP3 1299 aa16.89■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 GRM8O00222 908 aa16.88■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A1P11836 297 aa16.87■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.87■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 PIM2Q9P1W9 311 aa16.87■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.87■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCC4O15439 1325 aa16.87■□□□□ 0.29
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