RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.85■■□□□ 1.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF3CO14782 793 aa24.84■■□□□ 1.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 SUSD4Q5VX71 490 aa24.84■■□□□ 1.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 WDR63Q8IWG1 891 aa24.83■■□□□ 1.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.83■■□□□ 1.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 ALDH1B1P30837 517 aa24.82■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC93Q567U6 631 aa24.82■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 NTSR2O95665 410 aa24.81■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.81■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.81■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.81■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRELPP51888 382 aa24.8■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 HYPKQ9NX55 129 aa24.79■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRY2Q49AN0 593 aa24.78■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.78■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF521Q96K83 1311 aa24.78■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCIRG1Q13488 830 aa24.77■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 TSPYL6Q8N831 410 aa24.77■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 TOMM70O94826 608 aa24.76■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.76■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.75■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 NLRP10Q86W26 655 aa24.75■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.75■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 RRAGCQ9HB90 399 aa24.75■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 WDR90Q96KV7 1748 aa24.75■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 GLTPD2A6NH11 291 aa24.74■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 GOLGA2Q08379 1002 aa24.74■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.74■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.74■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.74■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.73■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 TAF1P21675 1872 aa24.72■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.72■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.72■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 OLFM4Q6UX06 510 aa24.72■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 HSPA6P17066 643 aa24.71■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.71■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.7■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF428Q96B54 188 aa24.7■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.7■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.69■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.69■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.68■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCN4AP35499 1836 aa24.68■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 STK31Q9BXU1 1019 aa24.67■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCC4O15439 1325 aa24.66■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.66■■□□□ 1.54
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USP46-AS1-201ENST00000503051 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.66■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYH3P11055 1940 aa24.66■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 PSMD1Q99460 953 aa24.65■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNED1Q8TER0 1413 aa24.64■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYD88Q99836 296 aa24.64■■□□□ 1.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 E9PSI1 815 aa24.63■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 FSTL1Q12841 308 aa24.63■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.63■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 VAMP4O75379 141 aa24.62■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 JDP2Q8WYK2 163 aa24.62■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM89AQ96GI7 184 aa24.62■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.61■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 APLP1P51693 650 aa24.6■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.6■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.6■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLFN5Q08AF3 891 aa24.59■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 GRAPQ13588 217 aa24.59■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.59■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 BBOX1O75936 387 aa24.58■■□□□ 1.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
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