RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 C8orf34Q49A92 452 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 SV2AQ7L0J3 742 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 TMC7Q7Z402 723 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 ZIC5Q96T25 663 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 BCS1LQ9Y276 419 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 PDE3BQ13370 1112 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 GIPC2Q8TF65 315 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 CITED4Q96RK1 184 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 F11P03951 625 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 PDGFAP04085 211 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 USP5P45974 858 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 IDH3AP50213 366 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 PLCB3Q01970 1234 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 CEP63Q96MT8 703 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 USP20Q9Y2K6 914 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-215ENST00000498054 E9PSI1 815 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 MAPK8P45983 427 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 WHAMMQ8TF30 809 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 GSK3AP49840 483 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ARSDP51689 593 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 KCNMA1Q12791 1236 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 EFHC2Q5JST6 749 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 SVOPQ8N4V2 548 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 OPLAHO14841 1288 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 SLURP2P0DP57 97 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 IER5Q5VY09 327 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 A6NHS1 94 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 TREHO43280 583 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 EPB42P16452 691 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 INPP5BP32019 993 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 GPR182O15218 404 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 EHHADHQ08426 723 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 GAS6Q14393 721 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 NLRP8Q86W28 1048 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 GJD3Q8N144 294 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 FAM129BQ96TA1 746 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 BCL11AQ9H165 835 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ADAMTS2O95450 1211 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 BRD7Q9NPI1 651 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 UNCXA6NJT0 531 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 H7C1W4 665 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 GPR25O00155 361 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGEF15O94989 841 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 NEFLP07196 543 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ATP2B2Q01814 1243 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 RASSF7Q02833 373 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 TYRO3Q06418 890 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 COL19A1Q14993 1142 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-215ENST00000498054 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 XYLBO75191 536 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 ORC1Q13415 861 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 DSC3Q14574 896 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 DBN1Q16643 649 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.14□□□□□ -1.27
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