RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	NPHP1	O15259	732 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	GRM1	Q13255	1194 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	GPC2	Q8N158	579 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	NUP98	P52948	1817 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	MCM10	Q7L590	875 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	PSMD1	Q99460	953 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	PRKAR2B	P31323	418 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RRM2-208	ENST00000487591	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	TAF1	P21675	1872 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	GPT	P24298	496 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	CXCL9	Q07325	125 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	AOC3	Q16853	763 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	MAP2K2	P36507	400 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	ECE1	P42892	770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	RGL2	O15211	777 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	NTSR2	O95665	410 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RRM2-208	ENST00000487591	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	LAMB2	P55268	1798 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	COL4A1	P02462	1669 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	EGFR	P00533	1210 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.63	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms