RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 NTSR2O95665 410 aa34.47■■■■□ 3.11
CCZ1B-211ENST00000486840 NLRP10Q86W26 655 aa34.46■■■■□ 3.11
CCZ1B-211ENST00000486840 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
CCZ1B-211ENST00000486840 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CCZ1B-211ENST00000486840 LMNB1P20700 586 aa34.45■■■■□ 3.11
CCZ1B-211ENST00000486840 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.45■■■■□ 3.11
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.45■■■■□ 3.11
CCZ1B-211ENST00000486840 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 SH3TC1Q8TE82 1336 aa34.43■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.42■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCC12Q96J65 1359 aa34.42■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 RASSF7Q02833 373 aa34.42■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.41■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC93Q567U6 631 aa34.41■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 TAOK3Q9H2K8 898 aa34.4■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ADCY9O60503 1353 aa34.39■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC4A2P04920 1241 aa34.39■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 CRY2Q49AN0 593 aa34.39■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC10A5Q5PT55 438 aa34.39■■■■□ 3.1
CCZ1B-211ENST00000486840 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 NEXNQ0ZGT2 675 aa34.37■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 RTKN2Q8IZC4 609 aa34.37■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 MYD88Q99836 296 aa34.37■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 RIC1Q4ADV7 1423 aa34.37■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 ISCA1Q9BUE6 129 aa34.36■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.35■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 NFKBIEO00221 500 aa34.34■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa34.34■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF428Q96B54 188 aa34.34■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 CRAMP1Q96RY5 1269 aa34.34■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 KSR2Q6VAB6 950 aa34.33■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa34.33■■■■□ 3.09
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM89AQ96GI7 184 aa34.32■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 VAMP4O75379 141 aa34.31■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 GRIPAP1Q4V328 841 aa34.31■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 LTBP3Q9NS15 1303 aa34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 PI4KAP2A4QPH2 592 aa34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC191Q8NCU4 936 aa34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.29■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 E9PSI1 815 aa34.28■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 C7orf43Q8WVR3 580 aa34.28■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 SLX4Q8IY92 1834 aa34.27■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.27■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.27■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 SYNE4Q8N205 404 aa34.27■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 BBOX1O75936 387 aa34.26■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 FLIIQ13045 1269 aa34.26■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 C3orf67Q6ZVT6 689 aa34.26■■■■□ 3.08
CCZ1B-211ENST00000486840 C1QTNF8P60827 252 aa34.25■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 CACNA1SQ13698 1873 aa34.22■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 G2E3Q7L622 706 aa34.22■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF521Q96K83 1311 aa34.22■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 OLFM4Q6UX06 510 aa34.21■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCC4O15439 1325 aa34.21■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 GRAPQ13588 217 aa34.2■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 TMC4Q7Z404 712 aa34.2■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
CCZ1B-211ENST00000486840 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.19■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 GLTPD2A6NH11 291 aa34.19■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 MIER1Q8N108 512 aa34.19■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa34.19■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAAF4Q8WXU2 420 aa34.18■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 JDP2Q8WYK2 163 aa34.18■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 PSMD1Q99460 953 aa34.18■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 SBF1O95248 1867 aa34.17■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 PRELPP51888 382 aa34.17■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 SUPT20HQ8NEM7 779 aa34.17■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 NMRK2Q9NPI5 230 aa34.17■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 PDE8AO60658 829 aa34.16■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 IARSP41252 1262 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC152Q4G0S7 254 aa34.16■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 RRAGCQ9HB90 399 aa34.16■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 SP8Q8IXZ3 490 aa34.15■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 SLFN5Q08AF3 891 aa34.14■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa34.14■■■■□ 3.06
CCZ1B-211ENST00000486840 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
CCZ1B-211ENST00000486840 NEURL1BA8MQ27 555 aa34.12■■■■□ 3.05
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