RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	MAP9	Q49MG5	647 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	SYT1	P21579	422 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	CHML	P26374	656 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	BRF1	Q92994	677 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	LMAN1	P49257	510 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	ISM2	Q6H9L7	571 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	DNAI1	Q9UI46	699 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	TDO2	P48775	406 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	MYD88	Q99836	296 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	STRN4	Q9NRL3	753 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	OGFR	Q9NZT2	677 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEGF6-205	ENST00000485002	LUZP1	Q86V48	1076 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	KRT24	Q2M2I5	525 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	SHTN1	A0MZ66	631 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	USP16	Q9Y5T5	823 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	POTEB2	H3BUK9	544 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	AIDA	Q96BJ3	306 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	ERLIN2	O94905	339 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	ODF2	Q5BJF6	829 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	ZMYM3	Q14202	1370 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	MCM3	P25205	808 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	UBASH3A	P57075	661 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	HYPK	Q9NX55	129 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	ANXA1	P04083	346 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	RAI14	Q9P0K7	980 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF213	O14771	459 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC102B	Q68D86	513 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	GOLIM4	O00461	696 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	18.16	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	TSC1	Q92574	1164 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	TUBB4A	P04350	444 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	SPA17	Q15506	151 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	SYK	P43405	635 aa		18.14	■□□□□ 0.5
MEGF6-205	ENST00000485002	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	PTPRT	O14522	1441 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	ATP10A	O60312	1499 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	NPAT	Q14207	1427 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A087WZG4	1122 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	ABCC1	P33527	1531 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	CPA1	P15085	419 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEGF6-205	ENST00000485002	HAND2	P61296	217 aa		18.13	■□□□□ 0.49

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