RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484065.2

TIA1-215, Transcript of TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein, human

TSL 5

Gene TIA1, Length 350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIA1-215	ENST00000484065	DKK1	O94907	266 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	RAC1	P63000	192 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	PSME1	Q06323	249 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	USP21	Q9UK80	565 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	RAD21	O60216	631 aa		5	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	FLII	Q13045	1269 aa		5	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	CCDC102B	Q68D86	513 aa		5	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	POTEA	Q6S8J7	498 aa		5	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		5	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		5	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		5	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		5	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	ATP9B	O43861	1147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	LILRB5	O75023	590 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	C21orf2	O43822	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	SFI1	A8K8P3	1242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	SIX5	Q8N196	739 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIA1-215	ENST00000484065	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065		M0R2N6	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	FST	P19883	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	ADH7	P40394	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	GLMN	Q92990	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	MED26	O95402	600 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	NOS3	P29474	1203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	KCNQ4	P56696	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	TYRO3	Q06418	890 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	LGR5	O75473	907 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	RASA1	P20936	1047 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	PTK7	Q13308	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	C8A	P07357	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	SEC13	P55735	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIA1-215	ENST00000484065	GSC2	O15499	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIA1-215	ENST00000484065	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIA1-215	ENST00000484065	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIA1-215	ENST00000484065	DPYD	Q12882	1025 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms