RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 SIL1Q9H173 461 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3C2AO00443 1686 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CHMLP26374 656 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM34Q9BYJ4 488 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-204ENST00000483092 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 SPG7Q9UQ90 795 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 BICD2Q8TD16 824 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD7Q92527 254 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 GTF3C6Q969F1 213 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 TNMDQ9H2S6 317 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 NUP62CLQ9H1M0 184 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 CEP135Q66GS9 1140 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K11Q16584 847 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ANO6Q4KMQ2 910 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 SMTNL1A8MU46 457 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ELF2Q15723 593 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNA2Q15822 529 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 FOSBP53539 338 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 NECAB1Q8N987 351 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 F13A1P00488 732 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 KCNH5Q8NCM2 988 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 CUL4AQ13619 759 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN14Q15678 1187 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 CASTP20810 708 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 GJB2P29033 226 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 FAM200AQ8TCP9 573 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 RNMTO43148 476 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 SLFN14P0C7P3 912 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 TERF2Q15554 542 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 SLIT1O75093 1534 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 AK2P54819 239 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 TYRO3Q06418 890 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 BEND3Q5T5X7 828 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 OSBPL3Q9H4L5 887 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 RGPD1P0DJD0 1748 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 BECN2A8MW95 431 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 DACT1Q9NYF0 836 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-204ENST00000483092 KIF18AQ8NI77 898 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC25Q9H1X3 360 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 SSH3Q8TE77 659 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 ARID5BQ14865 1188 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF165P49910 485 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 NALCNQ8IZF0 1738 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 FMN2Q9NZ56 1722 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 KIF1BPQ96EK5 621 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 TCEANC2Q96MN5 208 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 TMX1Q9H3N1 280 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 LIG1P18858 919 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 STK3Q13188 491 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CTIFO43310 598 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 CBX8Q9HC52 389 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 ANKARQ7Z5J8 1434 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 KMT5BQ4FZB7 885 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 AACSQ86V21 672 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-204ENST00000483092 SALL3Q9BXA9 1300 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms