RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 AACSQ86V21 672 aa21.55■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.55■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 ORAI2Q96SN7 254 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 HYPKQ9NX55 129 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 STX6O43752 255 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 SYT1P21579 422 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 SUCLG2Q96I99 432 aa21.53■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.53■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 LINS1Q8NG48 757 aa21.53■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 EVI5LQ96CN4 794 aa21.53■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.53■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 GRM8O00222 908 aa21.52■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 LARGE1O95461 756 aa21.52■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.52■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.52■■□□□ 1.04
SSR4-209ENST00000482902 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 AP5Z1O43299 807 aa21.51■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.51■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.035e-15■■■□□ 14.8
SSR4-209ENST00000482902 VPS53Q5VIR6 699 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 KAZALD1Q96I82 304 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 F13A1P00488 732 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 KCNB2Q92953 911 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 SASH1O94885 1247 aa21.49■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.49■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.49■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 UTYO14607 1347 aa21.49■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.49■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 SLIT3O75094 1523 aa21.49■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 NECTIN1Q15223 517 aa21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 GJB2P29033 226 aa21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 UBE2HP62256 183 aa21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.48■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 PDIA6Q15084 440 aa21.47■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 FAM227BQ96M60 508 aa21.47■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 FIBPO43427 364 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 DTNBO60941 627 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 KCNJ4P48050 445 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 FGD1P98174 961 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 HIP1O00291 1037 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 SIL1Q9H173 461 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SSR4-209ENST00000482902 IGKV5-2P06315 115 aa21.45■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 TPM3P06753 285 aa21.45■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 SLC39A6Q13433 755 aa21.45■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 MTMR6Q9Y217 621 aa21.45■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 PLCB2Q00722 1185 aa21.44■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.44■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 KLHL34Q8N239 644 aa21.44■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 MAP4K1Q92918 833 aa21.44■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 FEZ1Q99689 392 aa21.44■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.44■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 ST3GAL1Q11201 340 aa21.44■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 ME3Q16798 604 aa21.44■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 ZNF790Q6PG37 636 aa21.43■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.43■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 MYL6BP14649 208 aa21.43■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 NECAB1Q8N987 351 aa21.43■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.43■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 FSD1Q9BTV5 496 aa21.43■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 IGSF3O75054 1194 aa21.42■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.42■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 A0A0D9SFI3 127 aa21.41■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 SLC27A2O14975 620 aa21.41■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 SPC24Q8NBT2 197 aa21.41■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.41■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 ERBB3P21860 1342 aa21.41■■□□□ 1.02
SSR4-209ENST00000482902 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms