RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.05□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RNF181Q9P0P0 153 aa7.05□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.05□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRPC6Q9Y210 931 aa7.05□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 USP16Q9Y5T5 823 aa7.05□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LTBP1Q14766 1721 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBPF26B4DH59 902 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NFKBIEO00221 500 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RASSF7Q02833 373 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBPF15Q8N660 670 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CNBD1Q8NA66 436 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SETDB2Q96T68 719 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPEF2Q9C093 1822 aa7.04□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SRGNP10124 158 aa7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 APLP1P51693 650 aa7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ST5P78524 1137 aa7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FSTL1Q12841 308 aa7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DCTN1Q14203 1278 aa7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NFE2L2Q16236 605 aa7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 STYK1Q6J9G0 422 aa7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERBB4Q15303 1308 aa7.02□□□□□ -1.28
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GLTPD2A6NH11 291 aa7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NEFMP07197 916 aa7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SOGA3Q5TF21 947 aa7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CNKSR1Q969H4 720 aa7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MASTLQ96GX5 879 aa7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A1B0GUL6 1792 aa7.02□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL4A5P29400 1685 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCC12Q96J65 1359 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CRY2Q49AN0 593 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.01□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POTECB2RU33 542 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C21orf2O43822 256 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPR1P16066 1061 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HLFQ16534 295 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TPTE2Q6XPS3 522 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LRP10Q7Z4F1 713 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC24Q8N4L8 307 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM212AQ96EL1 285 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RRAGCQ9HB90 399 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MIS18AQ9NYP9 233 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 METRNQ9UJH8 293 aa7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SCN9AQ15858 1988 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 JMYQ8N9B5 988 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC39A7Q92504 469 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OTUD5Q96G74 571 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NYXQ9GZU5 481 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MRS2Q9HD23 443 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.99□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPHP1O15259 732 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C7P10643 843 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TIE1P35590 1138 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERFEQ4G0M1 354 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC93Q567U6 631 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KLRG1Q96E93 195 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms