RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	SUSD3	Q96L08	255 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	MCTP1	Q6DN14	999 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SUMO1-210	ENST00000469034	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	NAGPA	Q9UK23	515 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L5	A8MUK1	530 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	CCDC102B	Q68D86	513 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	POTEA	Q6S8J7	498 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	ALG2	Q9H553	416 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	NOS3	P29474	1203 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	PAX4	O43316	350 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	NFKB1	P19838	968 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM35A	Q86V20	835 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	CPB1	P15086	417 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	CCIN	Q13939	588 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	HIF1A	Q16665	826 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SUMO1-210	ENST00000469034	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	CLDN10	P78369	228 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034		M0R2N6	131 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	SSTR4	P31391	388 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	GRIK5	Q16478	980 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	PCSK7	Q16549	785 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	NGLY1	Q96IV0	654 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	C21orf2	O43822	256 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	TXK	P42681	527 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	FST	P19883	344 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	PLAUR	Q03405	335 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	MCM6	Q14566	821 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	ABCC9	O60706	1549 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	COBL	O75128	1261 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	IER5	Q5VY09	327 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC51A	Q86UW1	340 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SUMO1-210	ENST00000469034	EPB42	P16452	691 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	7.52	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	IRAK1	P51617	712 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms